民国年间的济南城，江湖之风还未褪色，各桥各地都有帮派管辖。
云峰会馆内，斧子章与楚天九为争夺地盘而大打出手。楚天九打输后，将气撒在了会馆卖艺的东方玉身上，并打伤了李三的母亲何氏。李三气不过，一刀砍破了楚天九的脸，好在济南警察署长李毅出现，救下了李三，并抓走了楚天九。楚天九身陷牢营，找了警察署副署长陈宇做靠山，要求将自己和早前被关进监狱的大哥楚天霸放出。陈宇试图贿赂李毅来放人，却遭到李毅的拒绝。
地下党员方俊生联系到李毅，告知济南的城防图被日本特务盗走，这背后存在着日本人的阴谋，希望李毅能够帮忙找回。李毅一路追查，终于找了盗走城防图的特务，带着陈宇连夜追赶。这时突然杀出一帮人马，将李毅砍伤，危机时刻，李毅拔枪射击，却被陈宇从背后捅了一刀。追杀李毅之人正是王兴，田成等几个陈宇的心腹部下。
决战燕子门剧照
陈宇在确认李毅死亡后，给自己也捅上一刀，佯装两人遭到黑帮袭击，拼死逃到了医院。第二天，总署署长前来医院探病，陈宇得知李毅只是身受重伤，却保住了性命。由于李毅身负重伤，不能履行署长一职，于是总署署长决定让这次行动中表现英勇的陈宇来担当代理署长，警察署落入了陈宇的手中。
决战燕子门第2集剧情介绍陈宇当上代理署长后，用保外就医的方法将楚天霸放了出来。斧子章本以为吃定了楚天九的地盘，带人到云峰会馆收保护费，结果却被刚放出来的楚天霸打的一败涂地。东方玉深知楚天九那帮人不好惹，想办法找到了田奎，田奎答应东方玉联系其兄-燕子侠东方白。赶走了斧子掌，楚天九要找李三报仇，李三被其追到了死胡同。情急之下李三使出了缩骨功，从狗洞中逃了出去。
陈宇知道李毅没死，一直心有余悸，担心李毅醒来后会揭露真相，于是陈宇隐藏身份来到医院，想要再次杀死李毅。正当陈宇用枕头要捂死李毅的时候，被前来探望救命恩人的李三凑巧碰到，陈宇不得不借故离开，但神色慌张的样子已经被李三知晓三分。
李毅醒来后，李三，何氏，还有东方玉一起来看望他。陈宇也为了试探情况假惺惺的来探望李毅。在医院里，陈宇看到了东方玉后一见钟情，想要邀请她一起看戏却遭到拒绝。
斧子掌在码头拿货，中了楚天霸的埋伏，全军覆没。为了庆祝，楚天霸一干人等又来到云峰会馆。楚天霸两兄弟知道陈宇喜欢东方玉，强行带东方玉陪酒。东方玉不从，陈宇表面放她走，背地却准备了阴招。
决战燕子门第3集剧情介绍楚天九半夜摸进东方玉的房间，想要强暴东方玉。东方玉身手敏捷，反倒将楚天九打晕，李三听到动静后赶到，将楚天九交到警局。陈宇亲自审理该案件，楚天九一口否认自己罪行，并嫁祸给东方玉。
东方玉和何氏大骂楚天九血口喷人，陈宇表面上假装站在东方玉一边。楚天九声称口说无凭，可以去东方玉家搜他给的大洋，来证明东方玉和自己的买卖关系而非强暴。陈宇派人“理所当然”的搜出了证据，并以此要挟东方玉就范。东方玉一气之下犯了病，一连几天躺在床上高烧不醒。
而此时，东方白已经赶到了济南，也得知了妹妹遭人欺负，气愤不已。刚从牢中出来的楚天霸想了个法子先敛财，再壮势力。于是他拿自己死了十年的母亲做大寿为由，要求大家进献贺礼。大寿最后一份大礼是东方白送来的棺材，楚天九正要带人收拾东方白，李三从门外飞到楚天九身边，一刀了解了他的性命。陈宇带着警察出现，抓走了李三。
东方白来到东方玉住处，得知刚才杀人的那小子就是救她妹妹的李三，于是决定救出李三。在李毅和东方白的周旋之下，李三免了死罪，却进了大牢。楚天霸咽不下弟弟被杀这口气，找到了当时监狱里的老大黑金，要他在监狱里干掉李三。
